Erstmals wurde 1258 ein Ortsadel erwähnt
Ende des 14. Jahrhunderts gehörte Wellendingen zur Herrschaft Hohenberg
Ab 1608 hatten die Herren von Freiberg die Ortsherrschaft inne
1803 kam der Ort an Württemberg und wurde 1806 dem Oberamt Rottweil zugewiesen
1974 schlossen sich Wellendingen und Wilflingen zusammen